מולקולות פולימריות גומי סיליקון הן מבנים דמויי שרשרת הנוצרים על ידי קשרי Si-O (סיליקון-חמצן), והמרכיב העיקרי שלהם הוא פוליסילוקסן מסה טוחנת גבוהה. מכיוון שהקשר של Si-O-Si הוא סוג הקשר הבסיסי שלו, אטומי הסיליקון קשורים בעיקר לקבוצות מתיל, וכמות קטנה מאוד של קבוצות בלתי רוויות מוצגות בשרשראות הצדדיות.
הכוחות הבין -מולקולריים הם קטנים, ולמולקולות יש מבנה סלילי. קבוצות מתיל מסודרות כלפי חוץ ויכולות להסתובב בחופשיות, מה שהופך את גומי הסיליקון לעמידות חום טובה יותר, בידוד חשמלי, יציבות כימית וכו 'מאשר גומי שכיח אחרים.
גומי סיליקון אופייני, כלומר Polydiformaldehyde Siloxane, יש תצורה מולקולרית סלילית עם כוחות אינטרמולקולריים קטנים יחסית, ובכך יש חוסן מעולה. בינתיים, קבוצות הפורמלדהיד שמצביעות מחוץ לסליל יכולות להסתובב בחופשיות, מה שמעניק גומי סיליקון עם תכונות פני השטח הייחודיות כמו הידרופוביות ואי-סטיקנות פני השטח